Masjid ini didirikan dan dikelola oleh Ishikawa Muslim Society (IMS) yang terdiri dari beragam bangsa seperti Pakistan, Mesir, Indonesia, Malaysia, Bangladesh, Jepang, dan beberapa negara lain. Masjid ini dikelola dengan sangat ketat sebagaimana tercantum di website resmi masjid. Hal ini tentunya untuk menjamin kenyamanan pengguna masjid dan warga sekeliling yang mayoritas bukan muslim. Karena dikelola oleh swadaya pengguna, maka para anggota IMS diharapkan memberikan sedekah secara rutin bulanan agar masjid bisa dikelola dan dipelihara dengan baik.

Penggunaan masjid dan wilayah sekitarnya berdasarkan nota kesepahaman dengan warga sekitar yang tertuang di dalam dokumen resmi. Para pengguna diharapkan mematuhi aturan dan kesepakatan bersama.