Di Kyoto terdapat satu mesjid yang menjadi pusat kegiatan umat Islam. Mesjid yang juga bernama Islamic Cultural Center ini dikelola oleh Kyoto Muslim Association (KMA). Di mesjid ini setiap hari jumat diselenggarakan Sholat Jum`at.

KMA sendiri terdiri dari dua lantai di sebuah apartemen kawasan Miyagakicho, dekat halte bis Konjinguchi dori. Mesjidnya sendiri menempati bagian bawah tanah, sementara lantai di atasnya menjadi kantor KMA sekaligus toko yang menjual makanan halal.